Namun, para peneliti terkejut melihat bahwa Omicron tidak menginduksi fusi sel, meskipun dikonfirmasi adanya infeksi virus dalam sel.
Omicron juga menunjukkan replikasi virus yang rendah di paru-paru – besarnya lebih rendah dari Delta dan strain Wuhan.
Masuknya SARS-CoV-2 ke dalam sel inang dapat terjadi melalui fusi permukaan sel setelah proteolisis oleh TMPRSS2 atau fusi endosom setelah endositosis dan aktivasi protease endosom.
Varian SARS-CoV-2 sebelumnya cenderung mengikuti opsi fusi permukaan sel, yang konsisten dengan TMPRSS2 tingkat tinggi. Dalam sel yang dikultur yang mendukung fusi permukaan sel, Delta menyebabkan infeksi kira-kira empat kali lipat lebih tinggi daripada Omicron.
Omicron mencapai tingkat infeksi yang lebih tinggi — 10 kali lipat lebih banyak daripada Delta — dalam sel HEK, yang terutama mendukung masuknya endosom.
Bukti lebih lanjut terlihat ketika sel yang diobati dengan inhibitor untuk entri endosomal resisten terhadap infeksi Omicron.***